Des gènes candidats et des haplotypes favorables peuvent faciliter les efforts de sélection basés sur des marqueurs visant à améliorer l’efficacité de l’utilisation du P dans B. napus.

Colza (Brassica napus) est l’une des cultures oléagineuses les plus importantes au monde. La carence en phosphore (P) réduit la hauteur de la plante et le nombre de branches Brassica napus. Cependant, les bases génétiques qui contrôlent la hauteur de la plante et le nombre de branches i B. napus Le déficit en P est largement inconnu. Liu et al. visait à déterminer mes gènes candidats pour la hauteur de la plante et le nombre de branches selon des études d’association pangénomique (GWAS) et des haplotypes à faible tolérance au P.

Colza. Image : Toile.

Panel d’associations de B. napus Cultivé au champ avec un faible apport de P (P, 0 kg ha-1) et un apport suffisant en P (P, 40 kg ha-1) sur 2 ans et la hauteur de la plante et le nombre de branches ont été étudiés. Plus de cinq millions de polymorphismes mononucléides (SNP) ont été utilisés pour effectuer la GWAS à la hauteur de la plante et au nombre de branches à deux apports de P contrastés.

Au total, 2127 SNP étaient fortement impliqués (P. <6 · 25 × 10−07(b) la hauteur de la plante et le nombre de branches à deux apports de P. La diversité phénotypique était significativement corrélée avec le nombre d’allèles favorables de loci apparentés sur les chromosomes A10 (chrA10_821671) et C08 (chrC08_27999846), ce qui contribuera à l’amélioration de la sélection grâce à l’agrégat de SNP qui . BnaA10g09290D et BnaC08g26640D ils ont été identifiés comme étant associés à chrA10_821671 et chrC08_27999846, respectivement. L’analyse de l’association des gènes candidats et l’analyse des haplotypes ont révélé que les lignées innées portant l’ATT étaient BnaA10g09290Hap1 et AAT à BnaC08g26640Hap1 ils avaient une plus grande hauteur de plante que les lignées avec d’autres allèles haplotypes à faible apport en P.

Ces loci SNP significatifs, allèles et haplotypes favorables, et les entrailles portées par ces allèles et haplotypes souhaitables seront utiles pour la sélection de tolérances à faible P-tolérance B. napus cultivars.

ARTICLE DE RECHERCHE

Liu, H., Wang, J., Zhang, B., Yang, X., Hammond, JP, Ding, G., Wang, S., Cai, H., Wang, C., Xu, F., Shi , L., 2021. Une étude d’association à l’échelle du génome du contrôle génétique de la hauteur des plantes et du nombre de branches en réponse à un stress à faible teneur en phosphore chez Brassica napus. Annales de botanique. https://doi.org/10.1093/aob/mcab115

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