David Pires : Utiliser des champignons pour lutter contre les ravageurs microscopiques des plantes

Les plantes sont incroyablement diverses, tout comme les botanistes ! Dans sa mission de diffuser les histoires étonnantes de la vie végétale, Botany One vous présente les scientifiques derrière ces grandes histoires.

Aujourd’hui, nous accueillons David Pires, un nématologue qui travaille à l’intersection de la santé des plantes et de la lutte durable contre les ravageurs. Ses recherches portent sur les nématodes parasites des plantes, des vers microscopiques qui infectent les plantes et peuvent causer des pertes importantes en agriculture et en foresterie. Pires s’intéresse particulièrement aux solutions fondées sur la nature pour lutter contre ces ravageurs, notamment la lutte biologique utilisant des ennemis naturels tels que les champignons. Il étudie actuellement ces approches contre le nématode du pin, un organisme de quarantaine dans de nombreux pays.

Pires est titulaire d’une licence en biologie-géologie et d’une maîtrise en écologie de l’Université du Minho, où il s’est d’abord spécialisé en nématologie végétale. Il est actuellement doctorant à l’Université d’Évora, au Portugal. Ses travaux dans des instituts de recherche portugais et dans des projets nationaux et européens combinent la biologie moléculaire, l’écologie et la protection appliquée des plantes pour comprendre comment les microbes bénéfiques peuvent supprimer les populations de nématodes dans les systèmes agricoles et forestiers.

En dehors de la recherche, Pires aime communiquer sur la science et contribuer à la communauté scientifique à travers des activités éditoriales. Les lecteurs intéressés à suivre son travail peuvent visiter son site Web, qui comprend des liens vers son travail et ses profils de réseaux sociaux.

Qu’est-ce qui vous a amené à vous intéresser aux plantes ?

En fait, je n’étais pas particulièrement attiré par les plantes lors de mes études de premier cycle en biologie et géologie. Mon intérêt est né lors de mon mémoire de maîtrise, qui consistait à sélectionner des cultivars de haricots communs pour leur résistance aux nématodes à galles. Travailler avec des plantes a révélé un monde souterrain auquel je n’avais jamais pensé : les racines sont des centres où une myriade de microbes, de champignons et d’organismes du sol interagissent, façonnant la santé des plantes de manière complexe. Bien sûr, j’avais appris cela pendant mes études, mais lorsque j’ai pleinement compris que des organismes microscopiques pouvaient déterminer la réussite ou l’échec d’une plante, ma perspective a changé. Depuis, la compréhension des réseaux écologiques, de la microbiologie et de la science appliquée des plantes me fascine et continue de guider mes recherches aujourd’hui.

Qu’est-ce qui vous a motivé à vous lancer dans votre domaine de recherche actuel ?

Pour être tout à fait honnête, mon entrée dans ce domaine ne s’est pas déroulée comme je l’avais initialement prévu. Lorsque je choisissais un sujet pour mon mémoire de maîtrise en écologie, j’avais un fort penchant pour la conservation de la faune, notamment celle du loup ibérique au Portugal. À l’époque, j’imaginais un travail de terrain qui s’apparentait à ce qu’on voit dans les documentaires sur la nature (les avantages d’être jeune et optimiste, ou carrément charmant). Un de mes professeurs m’a donné un conseil pragmatique : la recherche sur les grands mammifères est souvent difficile sur le plan logistique et bien moins glamour qu’il n’y paraît. Cette conversation m’a fait repenser mes options. Un autre sujet de thèse concernait le criblage de cultivars de haricots communs pour déterminer leur résistance aux nématodes à galles. J’ai décidé de saisir cette opportunité et je n’ai jamais regretté cette décision. Les nématodes parasites des plantes provoquent des milliards de pertes de récoltes dans le monde, mais sont souvent négligés car ils sont microscopiques. Au fil du temps, étudier des moyens durables de lutter contre ces ravageurs, notamment grâce à des micro-organismes bénéfiques, m’a semblé être la combinaison parfaite, puisque j’ai aussi toujours été très intéressé par la microbiologie.

Quelle est la partie que vous préférez de votre travail liée aux plantes ?

L’un de mes aspects préférés de la recherche sur les plantes est la découverte des interactions qui façonnent la santé des plantes. De nombreux facteurs qui déterminent si une plante pousse bien ou si elle devient malade résultent d’interactions biologiques complexes. Dans mes recherches actuelles, je m’intéresse particulièrement aux interactions tripartites entre le pin maritime, le nématode du pin (Bursaphelenchus xylophilus) et les champignons nématophages (champignons qui se nourrissent de nématodes). Comprendre comment ces organismes interagissent est très motivant pour moi, d’autant plus que j’explore comment ces champignons bénéfiques peuvent être efficacement cultivés et déployés comme agents de biocontrôle sur le terrain.

Un autre aspect que j’apprécie beaucoup est le caractère interdisciplinaire de la science végétale. Relever les défis liés à la santé des plantes nécessite l’intégration de la biologie moléculaire, de l’écologie, de la microbiologie et des pratiques agricoles ou forestières appliquées. Cette complexité signifie que des progrès significatifs dépendent souvent de la collaboration. Travailler avec des collègues de différentes disciplines, institutions et pays apporte de nouvelles perspectives à la recherche et conduit finalement à des solutions plus solides et plus innovantes.

Y a-t-il des plantes ou des espèces particulières qui ont intéressé ou inspiré vos recherches ? Si oui, quels sont-ils et pourquoi ?

Les pins sont d’importants puits de carbone dans le monde et, au Portugal, ils jouent un rôle vital à la fois sur le plan écologique et économique. Pinus pinaster la plus grande espèce de pin du pays, particulièrement menacée par le nématode du pin des bois. Ma recherche de doctorat porte sur Esteya spp. comme agents potentiels de lutte biologique fongique contre ce ravageur au Portugal et en Europe. Bien que ces champignons aient montré des résultats prometteurs dans la savane asiatique, l’application de ce succès aux écosystèmes européens nécessite une réflexion écologique minutieuse. J’y travaille depuis quatre ans et je suis très satisfait des résultats. Les manuscrits sont encore en préparation, je ne peux donc pas encore en révéler grand-chose, mais restez à l’écoute !

Pourriez-vous partager une expérience ou une anecdote de votre travail qui a éclairé votre carrière et réaffirmé votre intérêt pour les plantes ?

Le genre Fungi Esteya c’était au cœur de mes recherches de doctorat. Lors de mes débuts en 2021, j’ai été surpris de constater qu’aucune interaction écologique autre que celle avec son hôte, le pin, n’avait été étudiée depuis son rapport initial en 1999. Si l’on regarde ces interactions, le succès des stratégies de biocontrôle peut être fortement limité, surtout lorsqu’une suspension fongique est inoculée directement dans le stock.

Les plantes interagissent naturellement avec des microbiomes complexes qui habitent la phyllosphère, la rhizosphère ou l’endosphère. Même des espèces étroitement apparentées peuvent réagir de manière très différente au même inoculum microbien. Quand je réalise que je suis la première personne à étudier systématiquement les interactions Esteya spp. avec d’autres champignons dans des conditions contrôlées, et commencer à transférer ces connaissances à des pins hôtes vivants, a été le point culminant de ma carrière et continue d’alimenter mon intérêt pour les interactions plantes-microbes.

Quels conseils donneriez-vous aux jeunes scientifiques qui envisagent une carrière en biologie végétale ?

La curiosité pour le monde naturel est l’étincelle qui anime chaque scientifique. Si vous avez cette curiosité et la ténacité de la suivre, vous êtes fait pour être un scientifique ! Ne vous comparez pas aux autres : chaque carrière est unique, alors concentrez-vous à tracer votre propre chemin, guidé par vos intérêts et votre curiosité.

La biologie végétale est vaste et incroyablement interconnectée, alors restez ouvert à une approche interdisciplinaire. Au début de votre carrière, recherchez différentes expériences : travaillez dans différents laboratoires, collaborez au niveau national et international et apprenez de nouvelles techniques. La science suit rarement une ligne droite, c’est pourquoi l’adaptabilité et la résilience sont essentielles.

Enfin, développez de solides compétences en communication. Il est essentiel d’expliquer clairement vos recherches, tant à vos pairs qu’au public, d’autant plus que la science végétale est confrontée à des défis mondiaux tels que la sécurité alimentaire, la biodiversité et le changement climatique. Profitez de chaque occasion pour donner des conférences, des séminaires ou des présentations de conférence. Je dis cela en tant qu’introverti, mais cela vous sera grandement bénéfique à long terme. Faites confiance à votre instinct, restez curieux et bonne chance !

Qu’est-ce que les gens se trompent généralement à propos des plantes ?

Il existe une idée fausse répandue selon laquelle les plantes sont passives ou simples. Parce qu’ils ne changent pas d’une manière que nous percevons et opérons sur des échelles de temps très différentes des nôtres, ils sont souvent considérés comme des éléments statiques de l’environnement. En réalité, les plantes sont extrêmement dynamiques et réactives, formant des réseaux souterrains complexes et interagissant constamment avec d’autres organismes.

Une autre idée fausse est qu’il est facile de résoudre les problèmes des plantes. En agriculture et en foresterie, la santé des plantes dépend d’interactions complexes entre les ravageurs, les agents pathogènes, les organismes bénéfiques, les propriétés du sol et le climat. Comprendre ces réseaux est essentiel pour développer des solutions durables à long terme.

L’un des aspects les plus gratifiants de leur étude est de reconnaître la sophistication des plantes et des écosystèmes qu’elles abritent.

Image de couverture par David Pires.

Et voici la source pour plus d’infos.

Gabriel Durand

Rédacteur, Auteur, Journaliste | Plus de publications

Gabriel Durant est un journaliste et écrivain français spécialisé dans la région Occitanie. Né dans la ville de Perpignan, Gabriel a toujours été passionné par l'histoire, la culture et la langue de la région. Après avoir étudié la littérature et le journalisme à la Sorbonne, il a commencé à écrire pour le site web Vent d'Autan, où il couvre un large éventail de sujets liés à l'Occitanie. En plus de son travail de journaliste, Gabriel est également un romancier accompli.

David Pires : Utiliser des champignons pour lutter contre les ravageurs microscopiques des plantes

Gabriel Durand

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